Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRT82Q9NSB4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms