Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FZD3Q9NPG1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms