Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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