Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOBEC3GQ9HC16 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC3GQ9HC16 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms