Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms