Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP1Q9C000 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms