Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ8

KRTAP4-9, Keratin-associated protein 4-9, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-9Q9BYQ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TP53TG3C-201ENST00000360260 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 KRTAP4-7-201ENST00000391417 992 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 NPM1P32-201ENST00000412580 604 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL391730.1-201ENST00000413739 921 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL109754.1-201ENST00000449270 1036 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL133406.2-201ENST00000452363 1198 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL161785.1-201ENST00000455981 583 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC055758.2-202ENST00000482351 624 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM267-204ENST00000510130 721 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC079322.1-201ENST00000568345 1135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TP53TG3-208ENST00000569420 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TP53TG3B-205ENST00000569741 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC104758.5-201ENST00000569892 571 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AP005208.1-201ENST00000582863 208 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 RNASE9-211ENST00000611135 1108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 TP53TG3E-201ENST00000611321 1181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
KRTAP4-9Q9BYQ8 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms