Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms