Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX2Q99697 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms