Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf72Q96LT7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms