Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

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Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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EP400Q96L91 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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EP400Q96L91 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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EP400Q96L91 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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EP400Q96L91 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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EP400Q96L91 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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EP400Q96L91 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EP400Q96L91 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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