Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BICD1Q96G01 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms