Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C10orf55Q5SWW7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C10orf55Q5SWW7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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