Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms