Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDLIM3Q53GG5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms