Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms