Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TCEA2Q15560 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms