Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RABEP1Q15276 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms