Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL9A3Q14050 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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