Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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