Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NCOA4Q13772 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCOA4Q13772 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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