Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms