Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIAQ12857 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIAQ12857 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms