Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OC90Q02509 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OC90Q02509 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OC90Q02509 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms