Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD3P84022 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD3P84022 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms