Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSNK1EP49674 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms