Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACADSBP45954 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms