Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GRIA2P42262 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GRIA2P42262 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms