Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCGF2P35227 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms