Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5AP29375 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms