Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XPAP23025 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XPAP23025 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XPAP23025 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XPAP23025 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms