Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DMDP11532 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DMDP11532 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DMDP11532 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DMDP11532 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms