Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF888P0CJ79 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF888P0CJ79 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms