Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms