Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HACD1B0YJ81 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms