Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9Y3F1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9Y3F1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms