Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APEX2Q9UBZ4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms