Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERINC1Q9NRX5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms