Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf16Q9BUW7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf16Q9BUW7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms