Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms