Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms