Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRIQ1Q96JM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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