Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C18orf8Q96DM3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms