Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM4SF18Q96CE8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms