Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG4Q92954 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG4Q92954 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms