Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PHYHD1Q5SRE7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHYHD1Q5SRE7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms