Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHROOM2Q13796 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHROOM2Q13796 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
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