Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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RUNX3Q13761 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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