Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ALCAMQ13740 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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