Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDM2Q13029 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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